AMSTAR stands for A MeaSurement Tool to Assess systematic Reviews. There has been a proliferation of systematic reviews as one of the key tools for evidence-based health care. This has presented both opportunities and risks. [...] The risks include variation in quality and empirical validation.

Outil développé par Michael Gusenbauer permettant de comparer les bases de données pour cibler les bonnes ressources (ou simplement avoir une meilleure vision d'ensemble de ce que nous avons à disposition)

A free tool to give you the confidence to search the best databases available, so you find all you need, faster.

découvert grâce à Frédérique

Pour interroger tout le graphe (non divisé), il est possible d'utiliser QLever avec une syntaxe légèrement différente. Il s'agit d'une institution tierce qui fait une copie du graphe de manière régulière (tous les mois environ).
Exemple : Helen De Cruz (cf. ci-dessous)

PREFIX wikibase: <http://wikiba.se/ontology#>
PREFIX wd: <http://www.wikidata.org/entity/>
PREFIX wdt: <http://www.wikidata.org/prop/direct/>
PREFIX rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>

SELECT DISTINCT ?work ?label WHERE {
  { ?work (wdt:P50 | wdt:P98) wd:Q47189712 .
 } UNION { ?work wdt:P2093 "Helen De Cruz" .
 }
  OPTIONAL { ?work rdfs:label ?label FILTER(LANG(?label) = "en") }
}

outil de visualisation permettant de voir les intersections de plusieurs ensembles, pour dépasser les possibilités offertes par le diagramme de Venn

décrit dans LEX, Alexander, GEHLENBORG, Nils, STROBELT, Hendrik, VUILLEMOT, Romain et PFISTER, Hanspeter, 2014. UpSet: Visualization of Intersecting Sets. IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics [en ligne]. décembre 2014. Vol. 20, n° 12, pp. 1983‑1992. [Consulté le 25 août 2025]. DOI 10.1109/TVCG.2014.2346248. Disponible à l’adresse : https://ieeexplore.ieee.org/document/6876017

outil de dédoublonnage de références provenant de diverses bases de données

Removing duplicate references obtained from different databases is an essential step when conducting and updating systematic literature reviews. ASySD (pronounced "assist") is a tool to automatically identify and remove duplicate records.

À tester !

découvert grâce à Myriam (UNIGE)

Outil de recherche d'articles citant ou étant cité par une publication

Utile pour la phase de citation chasing d'une revue systématique moyennant de passer par l'API pour réaliser plusieurs requêtes, car l'interface de recherche semble limitée à la recherche d'une seule publication à la fois

Les données (publiées sous licence CC0) peuvent également être téléchargées pour travailler en local : https://download.opencitations.net/

"OpenCitations is managed by the Research Centre for Open Scholarly Metadata, an independent research centre within the University of Bologna." -- https://opencitations.net

Outil de recherche d'articles citant ou étant cité par un set de publications

Utile pour la phase de citation chasing d'une revue systématique

Citation.js (GitHub, NPM) converts formats like BibTeX, BibJSON, DOI, and Wikidata to CSL-JSON to convert to styles like APA, Vancouver and to BibTeX and RIS.

Pour en savoir plus, lisez l'article publié par PeerJ :

WILLIGHAGEN, Lars G., 2019. Citation.js: a format-independent, modular bibliography tool for the browser and command line. PeerJ Computer Science [en ligne]. 12 août 2019. Vol. 5, pp. e214. [Consulté le 3 août 2025]. DOI 10.7717/peerj-cs.214. Disponible à l’adresse : https://peerj.com/articles/cs-214

Toutes sortes d'outils qui peuvent s'avérer utiles lorsqu'on travaille avec Wikidata

Clean messy data and turn it into a knowledge graph with Ontotext Refine.

Liste d'outils à explorer et tester

Powerful evidence synthesis tools for medical researchers. Accelerate, collaborate, automate and share.

Outil d'aide à plusieurs étapes d'une revue systématique, mais dont je n'ai pas encore pu tester l'utilité, l'efficacité et la transparence...

Prometteur outil d'extraction de références d'un document textuel

À tester plus sérieusement lorsque j'ai du temps !

Pour formater correctement un fichier CSL

Formatting changes include:
Standard indentation
Escaping of certain characters that are hard to identify by eye, like non-breaking spaces and the various dashes
Standard ordering the child elements of <info/>
Standard ordering of attributes on <style/> and <link/> elements

Outil de compression d'images en ligne rapide et efficace proposant les formats JPG, WEBP, PNG, JPG-XL et AVIF en sortie

Le site annonce que

• les images ne sont pas stockées 👍
• la compression est faite pratiquement sans perte de qualité 👍
• le service est gratuit 👍 (il y a un version pro offrant plus de fonctionnalités)

On ne sait toutefois pas qui est derrière cette plateforme. ⚠️

découvert grâce à Korben

Detailed analysis of PubMed Search results

outil Kanban autohébergeable sous licence libre (AGPL-3.0) qui semble intéressant, notamment pour la fonction "minuteur"

À tester !

découvert grâce à Korben

Script pour archiver des pages web standalone, incluant toutes les images, CSS et js en un seul fichier HTML5

code source sur Github: https://github.com/Y2Z/monolith

découvert grâce à Korben

Aperçu des contenus, fonctions et particularités des plus importantes bases de données en santé (ou apparenté) sous forme de tableaux

Il est possible de rechercher de manière ciblée en fonction de ses besoins et de rassembler le résultat sous forme de liste de favoris individuelle, de les comparer et les télécharger sous forme de PDF.