Cours dispensés à John Hopkins University, destiné à faire des doctorants (dans le domaine biomédical en particulier) des chercheurs capables de réfléchir au delà du cadre étroit de leur discipline ou de leur labo

Glissez-déposez un document et hop! JSTOR Text Analyzer vous propose des publications similaires

Bien sûr c'est limité à la base de JSTOR, mais ça fonctionne très bien et en plus il y a moins d'affiner les résultats de façon très intuitive et facile.

Une nouvelle plateforme libre et open source de gestion d'un journal scientifique :-)

À tester!

Revue scientifique en Open Access (article publié en CC BY, mention de copyright au nom des auteurs) dont les instructions me plaisent beaucoup:

• article rédigé en Markdown
• le logiciel présenté doit être open source
• le(s) auteur(s) doi(ven)t avoir apporté une contribution majeure au logiciel
• le logiciel doit être complet (pas une version à moitié terminée)

Exemple de soumission d'article: https://github.com/arfon/fidgit/tree/master/paper

[EDIT 22/02/2017]
Fil Twitter des articles acceptés: https://twitter.com/joss_papers
Ce journal à un jumeau, The Journal of Open Source Education: https://gmva.ch/shaarli/?GZEwXA

Expliquer CRISPR à 5 personnes en respectant leur niveau de compréhension:

un enfant (durée: 55'')
une ado (durée: 1'35'')
une étudiant (durée: 1'40'')
une étudiante Master (durée: 2'25'')
un chercheur (durée: 9'10'')

Ateliers scientifiques pour les enfants de 8 à 12 ans à Lausanne, Genève et Fribourg (Suisse)

On peut même y organiser un anniversaire! C'est quand même autre chose que les anniversaire au McDo ou au LaserGame, non?

Outil de description et visualisation des contributions des différents co-auteurs d'un article scientifique
14 badges à disposition (allant du fundraising ou de l'administration du projet à la rédaction de l'article)

Code sous licence MPL 2.0: https://github.com/mozillascience/PaperBadger

Les articles open access publiés sous licence CC BY deviennent à ce point majoritaire qu'on peut penser que ce sera bientôt la règle.

Très bonne nouvelle pour la circulation et la reproductibilité de la science!

Infographie de David McCandless représentant les idées de scientifiques qui ont été ignorés, ridiculisés ou rejetés (quand ils n'ont pas été torturés ou mis à mort)... avant d'être réhabilités et leurs idées adoptées.

Cela nous rappelle que la communauté scientifique fonctionne parfois comme un religion!

Une revue scientifique open access sur Github ? C'est possible !
C'est le cas de ReScience.

Cette revue est d'un genre un peu particulier: elle promeut la reproduction de recherches déjà publiées, ainsi que les implémentations open source et nouvelles permettant de reproduire l'étude originale.

Du coup, tout est un peu différent de ce qui se fait d'habitude dans une revue scientifique "traditionnelle".
Ex. la soumission prend la forme d'une pull request et doit contenir un README.md (en Markdown donc) :-)

L'article doit évidemment être accompagné des données, du code et év. du notebook.

Les articles sont publiés en open access (CC BY). La mention de copyright est au nom des auteurs.

Nouveau overlay journal en sciences de l'information sur la communication scientifique

N'accepte que les recherches publiées en Open Access sous licence Creative Commons et propose de les annoter avec hypothes.is

Elsevier, qui prétend être l'un des plus grands éditeurs Open Access, prouve une fois de plus que ce qu'il prétend donner d'un côté il le bloque immédiatement de l'autre côté.

"The ETD+ Toolkit provides introductory training in a series of crucial data curation and digital longevity techniques. It has been designed as a training tool to help students identify and offset risks and threats to their digital research footprints."

Certainement une source d'inspiration :-)

Publier les protocoles d'expérience à part, leur attribuer un DOI et y faire référence dans les articles, voilà qui est très intéressant comme approche!

Cela permet de mettre en valeur le travail de , d'avoir plus de place pour décrire la méthodologie expérimentale, de plus facilement la réutiliser et/ou d'en créer de nouvelles versions.
En plein dans l'optique des publications dynamiques!

Cela résout également aussi un autre problème: est-ce que plagiat de recopier tel quel la partie matériel et méthode d'un article ? faut-il en citer la source ? si oui, laquelle: celle qu'on a consulté ou l'originale ? etc.

Politique de F1000 Research

intéressant!

À l'image de Software Carpentry, Author Carpentry propose des leçons clé en main, sous licence CC BY 4.0 dont le but "is to promote and support best practices in open science and research communication"

Magnifique!

For cost transparency about APC...

Intégration de Fidus Writer dans le processus de soumission et relecture d'une article dans une journal utilisant Open Journal System (OJS)

Code sur Github: https://github.com/OSCOSS/OJSIntegrationRestAPIplugin
Annonce sur le blog de Fidus Writer: https://www.fiduswriter.org/2017/03/20/fidus-writer-open-journal-systems-integration/

Le papier présentant le projet est sur arXiv: https://arxiv.org/abs/1703.04428

Directives pour ceux qui créent une revue scientifique et qui souhaitent qu'elle soit indexée par la plateforme scienceopen (l'indexation de 10 revues est gratuite)

Éditeur LaTeX et Markdown en ligne dont le modèle économique ressemble à celui d'Authorea (projets publics illimités, gratuit pour un projet privé, payant si on en veut plus)

L'intégration avec Mendeley me fait par contre penser que ce projet va plutôt se diriger vers quelque chose comme OverLeaf (sinon pourquoi Mendeley plutôt que Zotero)